Prof. Dr. U. Faigle, PD Dr. Winfried Hochstättler, Prof. Dr. R. Schrader, mit Alexander Schliep und Alexander Schönhuth Inhalt")?> Die beiden Themenkomplexe, die in diesem Seminar behandelt werden, sind Clusterverfahren für Proteinsequenzen bzw. für Expressionsprofile und Algorithmen für phylogenetische Bäume. Termine")?>
17. April
Oliver Martin über "A set-theoretic approach to database searching and clustering" von Antje Krause und Martin Vingron

8. Mai
Holger Klein über "ProtoMap: automatic classification of protein sequences and hierarchy of protein families " von Golan Yona, Nathan Linlal und Michal Linlan

15. Mai
Olaf Wendisch über "Clustering Gene Expression Patterns" von Amir Ben-Dor, Ron Shamir und Zohar Yakhin

22. Mai
Fällt aus wegen Dies Academicus der Universität.

29. Mai
Vera Grimm über "Large-Scale Clustering of cDNA-Fingerprinting data" von Ralf Herwig et al.

5. Juni
Nenad Stanojevic gibt eine Einführung in phylogenetische Bäume auf der Basis von "Biological Sequence Analysis" von Durbin et al.

19. Juni
Lars Kaderali über Simultaneous Alignment and Phylogeny - The Tree Alignment Problem auf Basis von "Biological Sequence Analysis" von Durbin et al. und "The Deferred Path Heuristic for the Generalized Tree Alignment Problem" von B. Schwikowski und M. Vingron.

26. Juni
ACHTUNG: TERMIN FÄLLT AUS!!!

3. Juli
Peter Pipenbacher über Weighted Neighbor Joining: A Likelihood-Based Approach to Distance-Based Phylogeny Reconstruction von W.J. Bruno, N.D. Socci und A.L. Halpern.

Materialien")?> Das Skript zur Vorlesung Informatik 1 (SS99) gibt im 1. Kapitel eine Einführung in die theoretische Komplexität von Algorithmen und in die groß-O (wie z.B. in O(n log(n))) Notation.

Der Vollständigkeit halber sei das Skript zur Vorlesung Informatik 2 (WS99/00) erwähnt.

Wer an weiterführendem Material Interesse hat, dem möchten wir das Buch Algorithms and Complexity von Herbert S. Wilf empfehlen. Da Out-of-print stellt Herb Wilf es als PDF-Datei zum kostenlosen Download zur Verfügung. Organisatorisches")?> Das Seminar findet jeweils montags, 10:30 - 12:00 im Seminarraum des ZAIK, Weyertal 80 statt.

Anfragen bitte an:
Alexander Schliep
Email: schliep@zpr.uni-koeln.de
Tel: (0221) 470-6040

     
und
     
Alexander Schönhuth
Email: aschoen@zpr.uni-koeln.de
Tel: (0221) 470-6019